Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps45P97390 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps45P97390 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vps45P97390 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps45P97390 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps45P97390 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps45P97390 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps45P97390 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps45P97390 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps45P97390 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps45P97390 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps45P97390 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps45P97390 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps45P97390 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps45P97390 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps45P97390 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps45P97390 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps45P97390 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps45P97390 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps45P97390 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps45P97390 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps45P97390 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vps45P97390 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps45P97390 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps45P97390 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps45P97390 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms