Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps3aP97351 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps3aP97351 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps3aP97351 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps3aP97351 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps3aP97351 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps3aP97351 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps3aP97351 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps3aP97351 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps3aP97351 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms