Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TnikP83510 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TnikP83510 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TnikP83510 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TnikP83510 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TnikP83510 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TnikP83510 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TnikP83510 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TnikP83510 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TnikP83510 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TnikP83510 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TnikP83510 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TnikP83510 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnikP83510 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnikP83510 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TnikP83510 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TnikP83510 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TnikP83510 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TnikP83510 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnikP83510 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnikP83510 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnikP83510 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnikP83510 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TnikP83510 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TnikP83510 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnikP83510 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnikP83510 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnikP83510 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TnikP83510 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnikP83510 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TnikP83510 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TnikP83510 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnikP83510 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnikP83510 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnikP83510 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TnikP83510 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TnikP83510 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnikP83510 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TnikP83510 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnikP83510 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnikP83510 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnikP83510 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TnikP83510 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnikP83510 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnikP83510 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnikP83510 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TnikP83510 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TnikP83510 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TnikP83510 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnikP83510 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnikP83510 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnikP83510 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnikP83510 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TnikP83510 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TnikP83510 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TnikP83510 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TnikP83510 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TnikP83510 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TnikP83510 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TnikP83510 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TnikP83510 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnikP83510 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnikP83510 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnikP83510 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TnikP83510 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TnikP83510 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TnikP83510 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TnikP83510 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnikP83510 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnikP83510 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TnikP83510 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TnikP83510 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TnikP83510 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TnikP83510 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TnikP83510 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TnikP83510 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TnikP83510 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TnikP83510 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnikP83510 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TnikP83510 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TnikP83510 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TnikP83510 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnikP83510 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TnikP83510 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TnikP83510 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TnikP83510 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TnikP83510 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TnikP83510 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnikP83510 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TnikP83510 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TnikP83510 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TnikP83510 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TnikP83510 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TnikP83510 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TnikP83510 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TnikP83510 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TnikP83510 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TnikP83510 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TnikP83510 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TnikP83510 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms