Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ext2P70428 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ext2P70428 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ext2P70428 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ext2P70428 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ext2P70428 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ext2P70428 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ext2P70428 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ext2P70428 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ext2P70428 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ext2P70428 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ext2P70428 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ext2P70428 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ext2P70428 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ext2P70428 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ext2P70428 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ext2P70428 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ext2P70428 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ext2P70428 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ext2P70428 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms