Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Plxna3P70208 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Plxna3P70208 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Plxna3P70208 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Plxna3P70208 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Plxna3P70208 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Plxna3P70208 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Plxna3P70208 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Plxna3P70208 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Plxna3P70208 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Plxna3P70208 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Plxna3P70208 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Plxna3P70208 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Plxna3P70208 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Plxna3P70208 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,76■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Plxna3P70208 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Plxna3P70208 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Plxna3P70208 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Plxna3P70208 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Plxna3P70208 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Plxna3P70208 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Plxna3P70208 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Plxna3P70208 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Plxna3P70208 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Plxna3P70208 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Plxna3P70208 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Plxna3P70208 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Plxna3P70208 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Plxna3P70208 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Plxna3P70208 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Plxna3P70208 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms