Protein–RNA interactions for Protein: P62835

Rap1a, Ras-related protein Rap-1A, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1aP62835 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rap1aP62835 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rap1aP62835 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rap1aP62835 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rap1aP62835 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rap1aP62835 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rap1aP62835 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rap1aP62835 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rap1aP62835 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rap1aP62835 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rap1aP62835 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rap1aP62835 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rap1aP62835 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms