Protein–RNA interactions for Protein: P62835

Rap1a, Ras-related protein Rap-1A, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1aP62835 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Rap1aP62835 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Rap1aP62835 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rap1aP62835 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rap1aP62835 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rap1aP62835 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rap1aP62835 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Rap1aP62835 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rap1aP62835 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Rap1aP62835 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Rap1aP62835 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Rap1aP62835 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Rap1aP62835 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Rap1aP62835 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rap1aP62835 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Rap1aP62835 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rap1aP62835 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rap1aP62835 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Rap1aP62835 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Rap1aP62835 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rap1aP62835 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rap1aP62835 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rap1aP62835 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rap1aP62835 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Rap1aP62835 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rap1aP62835 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Rap1aP62835 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Rap1aP62835 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rap1aP62835 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rap1aP62835 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rap1aP62835 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rap1aP62835 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rap1aP62835 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Rap1aP62835 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rap1aP62835 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Rap1aP62835 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Rap1aP62835 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rap1aP62835 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Rap1aP62835 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Rap1aP62835 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Rap1aP62835 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rap1aP62835 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rap1aP62835 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rap1aP62835 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Rap1aP62835 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rap1aP62835 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Rap1aP62835 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rap1aP62835 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rap1aP62835 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rap1aP62835 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rap1aP62835 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rap1aP62835 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rap1aP62835 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rap1aP62835 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rap1aP62835 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Rap1aP62835 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Rap1aP62835 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Rap1aP62835 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Rap1aP62835 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rap1aP62835 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rap1aP62835 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rap1aP62835 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Rap1aP62835 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Rap1aP62835 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Rap1aP62835 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Rap1aP62835 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Rap1aP62835 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Rap1aP62835 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Rap1aP62835 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Rap1aP62835 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Rap1aP62835 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Rap1aP62835 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Rap1aP62835 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Rap1aP62835 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Rap1aP62835 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Rap1aP62835 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Rap1aP62835 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Rap1aP62835 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Rap1aP62835 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rap1aP62835 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Rap1aP62835 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rap1aP62835 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Rap1aP62835 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Rap1aP62835 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Rap1aP62835 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Rap1aP62835 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Rap1aP62835 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Rap1aP62835 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rap1aP62835 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Rap1aP62835 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rap1aP62835 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rap1aP62835 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rap1aP62835 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rap1aP62835 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rap1aP62835 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rap1aP62835 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Rap1aP62835 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Rap1aP62835 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Rap1aP62835 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rap1aP62835 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,6 ms