Protein–RNA interactions for Protein: P62482

Kcnab2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab2P62482 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnab2P62482 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnab2P62482 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnab2P62482 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kcnab2P62482 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnab2P62482 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnab2P62482 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnab2P62482 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnab2P62482 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnab2P62482 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnab2P62482 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms