Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copz1P61924 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copz1P61924 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copz1P61924 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copz1P61924 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copz1P61924 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copz1P61924 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copz1P61924 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copz1P61924 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Copz1P61924 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copz1P61924 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copz1P61924 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copz1P61924 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copz1P61924 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copz1P61924 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copz1P61924 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copz1P61924 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms