Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uchl4P58321 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uchl4P58321 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uchl4P58321 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uchl4P58321 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Uchl4P58321 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uchl4P58321 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uchl4P58321 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Uchl4P58321 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uchl4P58321 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uchl4P58321 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uchl4P58321 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uchl4P58321 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uchl4P58321 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms