Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dpf3P58269 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dpf3P58269 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Dpf3P58269 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dpf3P58269 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dpf3P58269 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dpf3P58269 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dpf3P58269 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Dpf3P58269 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dpf3P58269 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dpf3P58269 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dpf3P58269 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dpf3P58269 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dpf3P58269 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Dpf3P58269 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dpf3P58269 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Dpf3P58269 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Dpf3P58269 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dpf3P58269 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dpf3P58269 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dpf3P58269 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dpf3P58269 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dpf3P58269 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dpf3P58269 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dpf3P58269 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dpf3P58269 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dpf3P58269 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dpf3P58269 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dpf3P58269 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Dpf3P58269 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dpf3P58269 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dpf3P58269 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dpf3P58269 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dpf3P58269 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Dpf3P58269 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms