Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh11P55288 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh11P55288 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh11P55288 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh11P55288 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh11P55288 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh11P55288 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh11P55288 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh11P55288 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh11P55288 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh11P55288 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh11P55288 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh11P55288 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh11P55288 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms