Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NrlP54846 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrlP54846 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NrlP54846 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NrlP54846 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NrlP54846 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NrlP54846 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NrlP54846 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NrlP54846 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NrlP54846 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NrlP54846 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NrlP54846 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NrlP54846 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NrlP54846 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NrlP54846 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrlP54846 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrlP54846 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrlP54846 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrlP54846 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrlP54846 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NrlP54846 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrlP54846 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NrlP54846 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NrlP54846 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrlP54846 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrlP54846 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NrlP54846 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrlP54846 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NrlP54846 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NrlP54846 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NrlP54846 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrlP54846 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrlP54846 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrlP54846 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrlP54846 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrlP54846 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrlP54846 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrlP54846 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrlP54846 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NrlP54846 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrlP54846 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrlP54846 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrlP54846 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NrlP54846 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrlP54846 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrlP54846 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrlP54846 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NrlP54846 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NrlP54846 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrlP54846 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrlP54846 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrlP54846 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NrlP54846 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NrlP54846 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrlP54846 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrlP54846 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrlP54846 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrlP54846 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrlP54846 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrlP54846 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NrlP54846 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NrlP54846 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrlP54846 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NrlP54846 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NrlP54846 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NrlP54846 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrlP54846 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NrlP54846 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrlP54846 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrlP54846 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrlP54846 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NrlP54846 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrlP54846 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NrlP54846 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrlP54846 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NrlP54846 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NrlP54846 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NrlP54846 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NrlP54846 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NrlP54846 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NrlP54846 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NrlP54846 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NrlP54846 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NrlP54846 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NrlP54846 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NrlP54846 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NrlP54846 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NrlP54846 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NrlP54846 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NrlP54846 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrlP54846 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NrlP54846 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrlP54846 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NrlP54846 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrlP54846 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NrlP54846 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NrlP54846 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrlP54846 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrlP54846 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NrlP54846 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms