Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RabggtbP53612 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RabggtbP53612 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RabggtbP53612 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RabggtbP53612 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RabggtbP53612 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RabggtbP53612 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RabggtbP53612 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RabggtbP53612 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RabggtbP53612 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RabggtbP53612 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RabggtbP53612 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RabggtbP53612 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RabggtbP53612 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RabggtbP53612 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RabggtbP53612 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RabggtbP53612 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RabggtbP53612 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RabggtbP53612 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RabggtbP53612 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RabggtbP53612 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RabggtbP53612 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RabggtbP53612 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RabggtbP53612 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RabggtbP53612 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RabggtbP53612 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RabggtbP53612 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RabggtbP53612 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RabggtbP53612 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RabggtbP53612 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RabggtbP53612 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RabggtbP53612 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RabggtbP53612 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RabggtbP53612 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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