Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc4P51655 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpc4P51655 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc4P51655 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gpc4P51655 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gpc4P51655 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gpc4P51655 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc4P51655 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc4P51655 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc4P51655 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpc4P51655 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc4P51655 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc4P51655 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms