Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Defa-rs12P50716 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Defa-rs12P50716 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Defa-rs12P50716 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Defa-rs12P50716 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Defa-rs12P50716 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Defa-rs12P50716 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Defa-rs12P50716 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Defa-rs12P50716 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Defa-rs12P50716 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Defa-rs12P50716 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Defa-rs12P50716 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Defa-rs12P50716 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Defa-rs12P50716 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Defa-rs12P50716 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Defa-rs12P50716 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Defa-rs12P50716 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Defa-rs12P50716 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Defa-rs12P50716 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Defa-rs12P50716 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Defa-rs12P50716 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Defa-rs12P50716 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Defa-rs12P50716 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Defa-rs12P50716 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Defa-rs12P50716 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Defa-rs12P50716 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Defa-rs12P50716 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Defa-rs12P50716 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Defa-rs12P50716 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Defa-rs12P50716 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms