Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArsaP50428 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ArsaP50428 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArsaP50428 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArsaP50428 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArsaP50428 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ArsaP50428 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ArsaP50428 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArsaP50428 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArsaP50428 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArsaP50428 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ArsaP50428 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArsaP50428 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ArsaP50428 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ArsaP50428 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArsaP50428 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArsaP50428 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArsaP50428 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArsaP50428 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArsaP50428 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArsaP50428 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArsaP50428 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArsaP50428 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArsaP50428 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArsaP50428 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ArsaP50428 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms