Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LtbrP50284 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LtbrP50284 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LtbrP50284 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LtbrP50284 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LtbrP50284 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LtbrP50284 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LtbrP50284 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LtbrP50284 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LtbrP50284 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LtbrP50284 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LtbrP50284 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LtbrP50284 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LtbrP50284 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LtbrP50284 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LtbrP50284 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LtbrP50284 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LtbrP50284 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LtbrP50284 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LtbrP50284 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LtbrP50284 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LtbrP50284 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LtbrP50284 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LtbrP50284 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LtbrP50284 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LtbrP50284 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LtbrP50284 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LtbrP50284 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LtbrP50284 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LtbrP50284 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LtbrP50284 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LtbrP50284 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LtbrP50284 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LtbrP50284 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LtbrP50284 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LtbrP50284 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LtbrP50284 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LtbrP50284 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LtbrP50284 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LtbrP50284 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LtbrP50284 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LtbrP50284 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LtbrP50284 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LtbrP50284 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LtbrP50284 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LtbrP50284 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LtbrP50284 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LtbrP50284 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LtbrP50284 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LtbrP50284 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LtbrP50284 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LtbrP50284 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LtbrP50284 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LtbrP50284 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LtbrP50284 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LtbrP50284 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LtbrP50284 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LtbrP50284 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LtbrP50284 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LtbrP50284 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms