Protein–RNA interactions for Protein: P48776

Tdo2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdo2P48776 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Tdo2P48776 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Tdo2P48776 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Tdo2P48776 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Tdo2P48776 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Tdo2P48776 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Tdo2P48776 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Tdo2P48776 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Tdo2P48776 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Tdo2P48776 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Tdo2P48776 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Tdo2P48776 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tdo2P48776 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Tdo2P48776 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tdo2P48776 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tdo2P48776 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Tdo2P48776 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Tdo2P48776 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Tdo2P48776 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Tdo2P48776 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Tdo2P48776 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Tdo2P48776 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,4 ms