Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps4bP46467 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps4bP46467 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps4bP46467 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps4bP46467 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps4bP46467 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps4bP46467 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps4bP46467 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps4bP46467 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps4bP46467 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps4bP46467 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps4bP46467 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps4bP46467 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps4bP46467 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps4bP46467 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps4bP46467 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps4bP46467 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps4bP46467 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps4bP46467 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps4bP46467 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps4bP46467 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps4bP46467 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps4bP46467 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms