Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Sept1P42209 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Sept1P42209 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Sept1P42209 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Sept1P42209 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Sept1P42209 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sept1P42209 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Sept1P42209 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sept1P42209 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sept1P42209 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sept1P42209 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Sept1P42209 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sept1P42209 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sept1P42209 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Sept1P42209 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sept1P42209 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Sept1P42209 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Sept1P42209 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Sept1P42209 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Sept1P42209 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Sept1P42209 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Sept1P42209 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Sept1P42209 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sept1P42209 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Sept1P42209 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Sept1P42209 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Sept1P42209 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Sept1P42209 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Sept1P42209 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Sept1P42209 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Sept1P42209 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Sept1P42209 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Sept1P42209 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Sept1P42209 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sept1P42209 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sept1P42209 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Sept1P42209 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Sept1P42209 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sept1P42209 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sept1P42209 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sept1P42209 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Sept1P42209 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sept1P42209 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Sept1P42209 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sept1P42209 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Sept1P42209 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Sept1P42209 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sept1P42209 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Sept1P42209 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms