Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc19a1P41438 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc19a1P41438 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc19a1P41438 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc19a1P41438 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc19a1P41438 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc19a1P41438 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc19a1P41438 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc19a1P41438 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc19a1P41438 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms