Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ighmbp2P40694 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ighmbp2P40694 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ighmbp2P40694 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ighmbp2P40694 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ighmbp2P40694 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ighmbp2P40694 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ighmbp2P40694 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ighmbp2P40694 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ighmbp2P40694 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ighmbp2P40694 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ighmbp2P40694 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ighmbp2P40694 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ighmbp2P40694 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ighmbp2P40694 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ighmbp2P40694 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ighmbp2P40694 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ighmbp2P40694 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ighmbp2P40694 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ighmbp2P40694 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ighmbp2P40694 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ighmbp2P40694 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms