Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LdlrP35951 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LdlrP35951 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdlrP35951 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LdlrP35951 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LdlrP35951 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LdlrP35951 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LdlrP35951 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LdlrP35951 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LdlrP35951 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LdlrP35951 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LdlrP35951 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LdlrP35951 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LdlrP35951 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LdlrP35951 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LdlrP35951 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LdlrP35951 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LdlrP35951 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdlrP35951 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LdlrP35951 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LdlrP35951 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LdlrP35951 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms