Protein–RNA interactions for Protein: P35294

Rab19, Ras-related protein Rab-19, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab19P35294 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20,25■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Rab19P35294 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,19■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20,19■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20,16■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Rab19P35294 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Rab19P35294 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Rab19P35294 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
Rab19P35294 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,01■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Rab19P35294 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19,96■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Rab19P35294 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Rab19P35294 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Rab19P35294 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,87■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19,86■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Rab19P35294 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,5 ms