Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Apoc1P34928 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoc1P34928 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoc1P34928 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoc1P34928 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Apoc1P34928 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apoc1P34928 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apoc1P34928 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apoc1P34928 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms