Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim2P33610 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prim2P33610 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prim2P33610 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prim2P33610 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prim2P33610 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prim2P33610 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prim2P33610 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prim2P33610 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim2P33610 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim2P33610 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim2P33610 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prim2P33610 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prim2P33610 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms