Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Pax4P32115 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Pax4P32115 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Pax4P32115 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Pax4P32115 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Pax4P32115 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Pax4P32115 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Pax4P32115 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Pax4P32115 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Pax4P32115 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Pax4P32115 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Pax4P32115 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Pax4P32115 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Pax4P32115 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Pax4P32115 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Pax4P32115 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,51■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Pax4P32115 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Pax4P32115 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Pax4P32115 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Pax4P32115 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Pax4P32115 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Pax4P32115 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Pax4P32115 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Pax4P32115 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Pax4P32115 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Pax4P32115 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Pax4P32115 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Pax4P32115 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Pax4P32115 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Pax4P32115 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Pax4P32115 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,2■■□□□ 1,3
Pax4P32115 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Pax4P32115 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Pax4P32115 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Pax4P32115 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Pax4P32115 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Pax4P32115 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Pax4P32115 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Pax4P32115 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94,2 ms