Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdgfbP31240 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfbP31240 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfbP31240 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PdgfbP31240 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PdgfbP31240 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdgfbP31240 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdgfbP31240 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdgfbP31240 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdgfbP31240 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdgfbP31240 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PdgfbP31240 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PdgfbP31240 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PdgfbP31240 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PdgfbP31240 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PdgfbP31240 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PdgfbP31240 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PdgfbP31240 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PdgfbP31240 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdgfbP31240 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PdgfbP31240 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdgfbP31240 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdgfbP31240 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PdgfbP31240 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PdgfbP31240 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PdgfbP31240 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PdgfbP31240 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PdgfbP31240 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfbP31240 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfbP31240 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfbP31240 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms