Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mep1aP28825 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mep1aP28825 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mep1aP28825 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mep1aP28825 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mep1aP28825 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mep1aP28825 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mep1aP28825 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mep1aP28825 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mep1aP28825 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mep1aP28825 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mep1aP28825 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mep1aP28825 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms