Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kif3aP28741 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kif3aP28741 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kif3aP28741 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kif3aP28741 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kif3aP28741 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kif3aP28741 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kif3aP28741 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kif3aP28741 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3aP28741 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kif3aP28741 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kif3aP28741 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Kif3aP28741 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kif3aP28741 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Kif3aP28741 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kif3aP28741 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kif3aP28741 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kif3aP28741 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms