Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Marcksl1P28667 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Marcksl1P28667 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Marcksl1P28667 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Marcksl1P28667 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Marcksl1P28667 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Marcksl1P28667 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Marcksl1P28667 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Marcksl1P28667 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Marcksl1P28667 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Marcksl1P28667 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Marcksl1P28667 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Marcksl1P28667 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Marcksl1P28667 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Marcksl1P28667 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Marcksl1P28667 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Marcksl1P28667 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Marcksl1P28667 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Marcksl1P28667 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Marcksl1P28667 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Marcksl1P28667 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Marcksl1P28667 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Marcksl1P28667 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Marcksl1P28667 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Marcksl1P28667 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Marcksl1P28667 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Marcksl1P28667 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Marcksl1P28667 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Marcksl1P28667 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Marcksl1P28667 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Marcksl1P28667 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Marcksl1P28667 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Marcksl1P28667 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms