Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Atxn10P28658 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Atxn10P28658 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Atxn10P28658 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Atxn10P28658 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Atxn10P28658 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,64■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,61■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Atxn10P28658 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Atxn10P28658 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Atxn10P28658 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Atxn10P28658 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Atxn10P28658 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atxn10P28658 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atxn10P28658 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atxn10P28658 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atxn10P28658 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atxn10P28658 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Atxn10P28658 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Atxn10P28658 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,1 ms