Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd9P28357 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd9P28357 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd9P28357 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd9P28357 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd9P28357 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd9P28357 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd9P28357 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd9P28357 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxd9P28357 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd9P28357 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd9P28357 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxd9P28357 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd9P28357 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms