Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apex1P28352 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apex1P28352 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apex1P28352 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apex1P28352 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apex1P28352 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apex1P28352 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apex1P28352 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apex1P28352 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apex1P28352 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apex1P28352 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apex1P28352 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apex1P28352 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apex1P28352 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apex1P28352 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apex1P28352 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apex1P28352 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apex1P28352 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apex1P28352 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apex1P28352 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apex1P28352 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apex1P28352 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apex1P28352 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apex1P28352 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apex1P28352 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apex1P28352 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apex1P28352 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apex1P28352 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apex1P28352 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apex1P28352 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apex1P28352 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms