Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SarsP26638 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SarsP26638 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SarsP26638 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SarsP26638 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SarsP26638 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SarsP26638 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SarsP26638 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SarsP26638 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SarsP26638 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SarsP26638 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SarsP26638 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SarsP26638 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SarsP26638 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SarsP26638 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SarsP26638 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SarsP26638 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SarsP26638 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SarsP26638 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SarsP26638 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SarsP26638 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SarsP26638 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SarsP26638 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SarsP26638 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SarsP26638 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SarsP26638 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SarsP26638 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SarsP26638 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SarsP26638 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SarsP26638 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SarsP26638 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SarsP26638 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SarsP26638 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SarsP26638 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SarsP26638 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SarsP26638 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SarsP26638 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SarsP26638 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SarsP26638 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SarsP26638 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SarsP26638 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SarsP26638 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SarsP26638 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SarsP26638 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SarsP26638 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SarsP26638 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SarsP26638 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SarsP26638 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SarsP26638 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SarsP26638 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SarsP26638 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SarsP26638 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SarsP26638 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SarsP26638 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SarsP26638 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SarsP26638 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SarsP26638 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SarsP26638 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SarsP26638 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SarsP26638 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SarsP26638 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SarsP26638 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SarsP26638 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SarsP26638 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SarsP26638 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SarsP26638 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SarsP26638 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SarsP26638 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SarsP26638 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SarsP26638 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SarsP26638 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SarsP26638 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SarsP26638 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SarsP26638 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SarsP26638 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SarsP26638 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SarsP26638 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SarsP26638 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SarsP26638 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SarsP26638 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SarsP26638 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SarsP26638 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SarsP26638 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SarsP26638 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SarsP26638 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SarsP26638 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SarsP26638 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SarsP26638 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SarsP26638 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SarsP26638 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SarsP26638 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SarsP26638 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SarsP26638 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SarsP26638 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SarsP26638 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SarsP26638 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SarsP26638 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SarsP26638 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SarsP26638 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SarsP26638 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms