Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LynP25911 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LynP25911 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LynP25911 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LynP25911 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LynP25911 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LynP25911 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LynP25911 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LynP25911 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LynP25911 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LynP25911 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LynP25911 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LynP25911 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LynP25911 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LynP25911 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LynP25911 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LynP25911 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LynP25911 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LynP25911 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LynP25911 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LynP25911 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LynP25911 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LynP25911 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LynP25911 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LynP25911 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LynP25911 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LynP25911 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LynP25911 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LynP25911 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LynP25911 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LynP25911 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LynP25911 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LynP25911 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LynP25911 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LynP25911 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LynP25911 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LynP25911 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LynP25911 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LynP25911 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LynP25911 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LynP25911 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LynP25911 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LynP25911 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LynP25911 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LynP25911 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LynP25911 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LynP25911 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LynP25911 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LynP25911 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LynP25911 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LynP25911 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LynP25911 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LynP25911 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LynP25911 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LynP25911 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LynP25911 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LynP25911 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LynP25911 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LynP25911 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LynP25911 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LynP25911 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LynP25911 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LynP25911 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LynP25911 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LynP25911 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LynP25911 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LynP25911 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LynP25911 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LynP25911 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LynP25911 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LynP25911 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LynP25911 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LynP25911 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LynP25911 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LynP25911 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LynP25911 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LynP25911 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LynP25911 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LynP25911 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LynP25911 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LynP25911 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LynP25911 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LynP25911 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LynP25911 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LynP25911 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LynP25911 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LynP25911 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LynP25911 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LynP25911 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LynP25911 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LynP25911 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LynP25911 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LynP25911 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LynP25911 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LynP25911 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LynP25911 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LynP25911 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LynP25911 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LynP25911 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LynP25911 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.6 ms