Protein–RNA interactions for Protein: P25206

Mcm3, DNA replication licensing factor MCM3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm3P25206 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mcm3P25206 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mcm3P25206 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mcm3P25206 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mcm3P25206 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mcm3P25206 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mcm3P25206 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mcm3P25206 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mcm3P25206 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mcm3P25206 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mcm3P25206 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mcm3P25206 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Mcm3P25206 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mcm3P25206 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mcm3P25206 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mcm3P25206 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mcm3P25206 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mcm3P25206 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mcm3P25206 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mcm3P25206 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Mcm3P25206 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mcm3P25206 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mcm3P25206 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mcm3P25206 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mcm3P25206 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mcm3P25206 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mcm3P25206 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mcm3P25206 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms