Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb1P17919 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb1P17919 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb1P17919 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb1P17919 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb1P17919 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb1P17919 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb1P17919 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb1P17919 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb1P17919 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb1P17919 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxb1P17919 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb1P17919 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb1P17919 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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