Protein–RNA interactions for Protein: P14106

C1qb, Complement C1q subcomponent subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qbP14106 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qbP14106 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C1qbP14106 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1qbP14106 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qbP14106 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1qbP14106 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qbP14106 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1qbP14106 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qbP14106 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1qbP14106 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qbP14106 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1qbP14106 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1qbP14106 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1qbP14106 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1qbP14106 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1qbP14106 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1qbP14106 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1qbP14106 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qbP14106 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1qbP14106 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qbP14106 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qbP14106 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1qbP14106 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1qbP14106 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1qbP14106 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qbP14106 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qbP14106 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qbP14106 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qbP14106 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms