Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Il1r1P13504 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Il1r1P13504 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Il1r1P13504 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Il1r1P13504 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Il1r1P13504 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Il1r1P13504 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Il1r1P13504 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms