Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RapsnP12672 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RapsnP12672 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RapsnP12672 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RapsnP12672 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RapsnP12672 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RapsnP12672 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RapsnP12672 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RapsnP12672 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RapsnP12672 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RapsnP12672 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RapsnP12672 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RapsnP12672 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RapsnP12672 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RapsnP12672 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RapsnP12672 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RapsnP12672 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RapsnP12672 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RapsnP12672 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RapsnP12672 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RapsnP12672 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RapsnP12672 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RapsnP12672 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RapsnP12672 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RapsnP12672 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RapsnP12672 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RapsnP12672 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RapsnP12672 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RapsnP12672 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RapsnP12672 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RapsnP12672 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RapsnP12672 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms