Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa1P11477 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa1P11477 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa1P11477 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa1P11477 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa1P11477 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa1P11477 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa1P11477 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa1P11477 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa1P11477 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa1P11477 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa1P11477 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa1P11477 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa1P11477 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa1P11477 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms