Protein–RNA interactions for Protein: P11152

Lpl, Lipoprotein lipase, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LplP11152 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LplP11152 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LplP11152 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LplP11152 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LplP11152 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LplP11152 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LplP11152 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LplP11152 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LplP11152 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LplP11152 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LplP11152 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LplP11152 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LplP11152 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LplP11152 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LplP11152 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LplP11152 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LplP11152 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LplP11152 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LplP11152 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LplP11152 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LplP11152 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LplP11152 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LplP11152 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LplP11152 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LplP11152 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LplP11152 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LplP11152 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LplP11152 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LplP11152 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LplP11152 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LplP11152 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LplP11152 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LplP11152 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LplP11152 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LplP11152 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LplP11152 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LplP11152 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LplP11152 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LplP11152 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LplP11152 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LplP11152 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LplP11152 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LplP11152 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LplP11152 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LplP11152 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LplP11152 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LplP11152 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LplP11152 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LplP11152 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LplP11152 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LplP11152 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LplP11152 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LplP11152 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LplP11152 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LplP11152 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LplP11152 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LplP11152 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LplP11152 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LplP11152 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LplP11152 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LplP11152 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LplP11152 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LplP11152 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LplP11152 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LplP11152 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LplP11152 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LplP11152 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LplP11152 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LplP11152 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LplP11152 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LplP11152 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LplP11152 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LplP11152 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LplP11152 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LplP11152 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LplP11152 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LplP11152 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LplP11152 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LplP11152 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LplP11152 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LplP11152 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LplP11152 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LplP11152 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LplP11152 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LplP11152 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LplP11152 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LplP11152 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LplP11152 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LplP11152 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LplP11152 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LplP11152 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LplP11152 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LplP11152 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LplP11152 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LplP11152 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LplP11152 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LplP11152 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LplP11152 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LplP11152 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LplP11152 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms