Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amd1P0DMN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Amd1P0DMN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Amd1P0DMN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Amd1P0DMN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Amd1P0DMN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Amd1P0DMN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Amd1P0DMN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Amd1P0DMN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms