Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UbbP0CG49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UbbP0CG49 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UbbP0CG49 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UbbP0CG49 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UbbP0CG49 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UbbP0CG49 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UbbP0CG49 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.7 ms