Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf3P09920 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csf3P09920 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csf3P09920 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf3P09920 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf3P09920 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf3P09920 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf3P09920 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3P09920 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3P09920 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3P09920 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf3P09920 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf3P09920 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf3P09920 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Csf3P09920 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csf3P09920 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csf3P09920 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csf3P09920 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3P09920 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3P09920 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csf3P09920 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf3P09920 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf3P09920 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csf3P09920 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Csf3P09920 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csf3P09920 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms