Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
P06344 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P06344 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P06344 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06344 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06344 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P06344 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
P06344 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P06344 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P06344 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P06344 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P06344 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P06344 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P06344 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P06344 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P06344 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P06344 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P06344 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P06344 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P06344 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P06344 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P06344 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P06344 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P06344 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P06344 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P06344 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P06344 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P06344 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
P06344 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P06344 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P06344 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P06344 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P06344 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P06344 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P06344 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P06344 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P06344 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
P06344 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P06344 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P06344 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P06344 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P06344 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P06344 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P06344 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P06344 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P06344 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P06344 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P06344 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P06344 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P06344 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P06344 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P06344 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P06344 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P06344 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P06344 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
P06344 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P06344 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P06344 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P06344 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P06344 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P06344 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P06344 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P06344 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P06344 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P06344 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P06344 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P06344 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P06344 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P06344 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P06344 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P06344 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P06344 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P06344 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P06344 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P06344 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P06344 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P06344 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P06344 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P06344 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P06344 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P06344 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P06344 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P06344 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P06344 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P06344 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P06344 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P06344 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P06344 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P06344 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P06344 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P06344 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P06344 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P06344 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P06344 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P06344 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P06344 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P06344 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P06344 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P06344 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P06344 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms