Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04224 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04224 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P04224 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04224 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04224 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04224 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04224 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P04224 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P04224 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04224 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04224 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04224 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P04224 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04224 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P04224 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04224 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P04224 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P04224 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04224 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P04224 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
P04224 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04224 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04224 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P04224 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P04224 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04224 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04224 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P04224 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04224 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04224 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
P04224 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04224 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P04224 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04224 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P04224 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P04224 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04224 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04224 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04224 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P04224 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04224 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P04224 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P04224 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P04224 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
P04224 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P04224 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04224 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P04224 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04224 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04224 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P04224 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04224 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P04224 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04224 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
P04224 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04224 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P04224 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P04224 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P04224 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P04224 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P04224 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P04224 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P04224 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04224 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P04224 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P04224 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P04224 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P04224 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04224 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P04224 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P04224 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04224 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04224 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04224 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P04224 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P04224 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04224 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P04224 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P04224 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P04224 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04224 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04224 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P04224 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P04224 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04224 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04224 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P04224 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04224 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04224 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P04224 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04224 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04224 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04224 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04224 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04224 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04224 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04224 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04224 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04224 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms