Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01821 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01821 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01821 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01821 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01821 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01821 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01821 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01821 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01821 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01821 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01821 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01821 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01821 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01821 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01821 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01821 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01821 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01821 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01821 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01821 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01821 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01821 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01821 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01821 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01821 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01821 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01821 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01821 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01821 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01821 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01821 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01821 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01821 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01821 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01821 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01821 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01821 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01821 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01821 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01821 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01821 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01821 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01821 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01821 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01821 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01821 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01821 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01821 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01821 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01821 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01821 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01821 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01821 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01821 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01821 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01821 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01821 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01821 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01821 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01821 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01821 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01821 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01821 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01821 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01821 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01821 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01821 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01821 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01821 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01821 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01821 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01821 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01821 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01821 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01821 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01821 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01821 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01821 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01821 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01821 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01821 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01821 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01821 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01821 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01821 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01821 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01821 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01821 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01821 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01821 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01821 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms